(1)太阳能消毒：在播种前，把地翻平整好，用薄膜覆盖好，晴天土壤温度可升至50-60℃，密闭15-20天，可杀死土壤中的多种病菌。

(2)蒸汽消毒：将备用土壤堆积，覆盖，然后通蒸汽，利用产生的高温消毒，一般持续7天，这种方法消毒没有任何毒害产生。

(3)药剂消毒：常用福尔马林、井冈霉素、氯化苦、溴甲烷、甲基托布津、多菌灵、敌百虫等。配制营养土时，每立方米营养土加入70%甲基托布津或50%多菌灵100克，或90%敌百虫20克，或雷多米尔5-7克，或用0.5%福尔马林喷洒床土。喷后混合均匀，密封堆置5-7天，然后揭开药膜，使得药剂气味挥发，可以有效地防止苗床猝倒病和菌核病。