特殊的结构特点和颜色变化极为丰富，这使它与别的玉石较容易区分。不过某些颜色的品种有时与其它玉石相似。

　　半透明蓝绿色独山玉与高品质的翡翠外观相近，但是翡翠为纤维交织结构与独山玉的粒状结构明显不同，通过折射率值、密度值测试很容易将二者区分。而且此种独玉颜色因含铬云母所致，在查尔斯滤色镜下变红，另外，独山玉绿色偏蓝，常夹有暗色矿物的黑点，这些特征与相似的翡翠亦明显有别。

　　白独玉易与外观相似的石英质玉石和软玉中的白玉相混淆，白玉的结构是毡状结构，非常细腻，光泽一般为玻璃-油脂光泽，这些和独山玉很容易区分，石英质玉石虽然也是粒状结构，但它的折射率和比重都明显低于独山玉，所以也很好区分。