1、由于同居生的孩子抚养权归谁的问题实际上属于一个民事问题，所以双方当然可以就同居生的孩子抚养权归谁达成协议。对于同居生的孩子抚养权归谁这样的问题，一般先由父母协商确定。
2、如果双方对同居生的孩子抚养权归谁难以达成协议，则可以通过提起诉讼请求法院判决确定。