眼斑水龟的外观与四眼斑水龟很相似，很难区分和鉴别，确实是这样，在正常情况下，如果龟缩在甲壳内是区分不出来的，但是头部的变化是很明显的，我们可以根据头部的特点进行鉴别。

　　眼斑水龟，体型中等，成年龟甲长14厘米左右。头背皮肤光滑，灰棕色，头、背均布满棕黑色或铁锈色虫状斑纹，头后两侧各有1~2对眼斑状花纹，有的头顶还有虫纹，两对眼斑分界不清。背甲灰棕色，较平，具一纵棱。腹甲平坦，略与背甲等长，前缘平切，后缘略凹。四肢灰棕色.，前肢外侧具若干大鳞。指(趾)间全蹼，前肢5爪，后肢4爪。尾细。

　　眼斑水龟背面色深，腹面色浅。眼斑水龟，头顶的两对眼斑界线清晰，背甲呈棕色，腹甲淡黄色并杂有黑色斑点。其他略与眼斑水龟同。体型适中。上喙不呈钩状，头后侧各有2对眼斑，每个眼斑中有一黑点，颈部有条纵纹。其背甲棕色且具花纹，后缘不呈锯齿状或略呈锯齿状。腹甲淡黄色，每块盾片均有黑色大小斑点，背甲与腹甲间借骨缝相连。