1、外观区别，巴旦木仁果壳比较薄，果仁是土黄色，为椭圆形，个头较大；杏仁果壳比较坚硬，果仁表明有条状沟壑，还有一层棕色的果皮，一端比较圆，另一端比较坚，个头要比巴旦木仁小。

2、产地区别，巴旦木仁中国产地集中分布在新疆地区，是新疆维吾尔人民最珍视的干果，主要产在天山以南喀什绿洲的疏附、英吉沙、莎车、叶城等县；杏仁产区分布较广，除了广东海南等地。