没有经过充分发酵的菜籽饼肥不能直接使用，否则的话可能会烧死作物的根系，从而出现烧根以及肥害的情况，因此建议科学施肥。

菜籽饼肥属于热性肥料，菜籽饼直接使用在土里会进行二次发酵，产生的高温就会损伤烧死植物根系。所以，建议发酵后食用。快速发酵可以利用发酵剂，发酵剂是益生菌制剂，能让菜籽饼在短期内透彻腐熟发酵，提高菜籽饼肥效的吸收利用率。

菜籽饼发酵后有机肥，蛋白质，氨基酸、氮磷钾物质被很好的分解，能被植物更好的吸收，而且在腐熟过程中产生的高温能杀死菜籽饼中虫害等，再加上种植菌液中的大量有益菌杀菌抑菌，从而达到抑制将病害的效果，作物少生病，长势好。

菜籽饼发酵有机肥经过发酵剂发酵后，含有大量的益生菌群，他们迅速繁殖可以改善土壤结构，达到土壤微生物平衡，疏松土壤，保水保肥，使作物更好的吸收养分。