1、性质不同。专家门诊：是由专家获得卫生部资质审核通过在册的专家（一般是副主任医师以上的医生）坐诊的门诊。专科门诊：是专门的科室门诊类型。

2、挂号不同。专家门诊：专家出诊和专家坐诊不同的是专家出诊是预约挂号，根据预约来安排出诊日期，而坐诊一般是上班时间内限制一定的诊断人数的。专科门诊：就诊挂普通号，让主治医师对患者的病情进行初步的判断，确定是否该看这个专科。