由于雌、孕激素水平周期性的变化，在月经周期中，女性生殖系统，如阴道粘膜、子宫颈粘液、输卵管及乳腺也会出现周期性变化。

阴道粘膜变化

排卵前，在雌激素作用下阴道上皮细胞增生，使上皮厚度增加，表层细胞逐渐角化。细胞内所含的糖元在阴道杆菌作用下转变为乳酸，使阴道呈酸性环境，有效地预防了细菌繁殖或侵入子宫。排卵后，阴道上皮在孕激素作用下发生大量脱落。因此临床上常根据阴道脱落细胞的变化情况来了解卵巢功能是否正常。

子宫颈的变化

月经刚净后，体内激素水平相对处于低潮，此时子宫颈管分泌的粘液量也相对很少。随着卵巢中卵泡的快速生长，分泌了大蛩雌激素，使体内雌激素水平处于一个相对髙的水平，此时宫颈粘液分泌量也随之增加，且质稀薄而透明，并在排卵期达高峰，此时粘液干燥后在低倍显微镜下可见羊齿植物叶状结晶。排卵后，受孕激素影响，粘液童减少，且粘稠而混浊，延展性差，易断裂。宫颈粘液在月经周期第22天完全消失，代之的是排列成行的椭圆体。

输卵管变化

在排卵期，输卵管粘膜充血肥厚，伞部平滑肌收缩，有利于卵子进入输卵管，同时在孕酮作用下，由于纤毛运动和肌层收缩，将卵子向子宫推进。

乳腺组织变化

排卵前期，乳腺组织受雌激素的影响，出现了增生性变化，如乳房增大，紧张而坚实，甚至有胀痛和肿块触及。排卵期后，由于黄体形成，乳腺由增生期逐渐转人分泌期，当黄体萎缩，雌、孕激素分泌下降导致月经来潮后，乳腺出现复旧性变化，如乳房变小变软，胀痛消失。