1、计算单位不同。自然日是以天为单位，即24小时。自然日通俗的讲就是指一天24小时，包括正常的工作日、周末休息日，也包括国家法定节假日，是针对工作日提出的。工作日是以小时为单位，是指法律规定的一昼夜内的工作时间的时数，我国工作日的工作时间为8小时。

2、计算周期不同。自然日不区分周中和周末，即周一至周日都为自然日。工作日即周一至周五，周六和周天不纳入工作日的计算范畴，工作日通常分为四种，即标准工作日，特殊条件下的缩短工作日、延长工作日和无定时工作日。