辣椒整枝的目的不仅是为了增加通风透光度，也是为了调节植株生长势，使其形成壮棵，提高产量及品质。在整枝方面，疏枝、抹权显得非常重要。

(1)四主枝结果改为两主枝结果。由于年前棚内温湿度适宜，营养供应充足，植株长势健壮，可留下四条主枝结果。而第一茬果采收后（此时已是第二年春天），为使植株尽快恢复生长，提早结果，可疏除两条生长较弱的结果主枝，留下另外两条强壮的主枝结果，使根系吸收的营养集中供应两条结果主枝生长，减少营养消耗，利于提高辣椒植株的生长势，培育壮棵。

(2)勿过早疏除侧枝。生产中，有些菜农在第一批果实坐住后，就疏除主枝上的侧枝，果实下面的侧枝也全部疏除，而对于果实上部的侧枝，除了保留已坐果的侧枝外，也全部疏除了。这样不妥，因为过早疏除侧枝，不仅制造的有机营养少，而且无法形成壮棵。建议在第一批果采摘后，植株上部开始开花坐果时再适当疏除部分侧枝。