蒜种贮藏期间的温度对二次生长有显著影响，低温有促进作用，但不同品种对低温的反应程度有差异。

蔡家坡红皮蒜对低温(0-5℃)和冷凉(14-16℃)条件的反应最敏感，外层型和内层型二次生长均大幅度增加，其中内层型二次生长的增加幅度更大。苍山大蒜对低温和冷凉条件的反应次之，外层型和内层型二次生长也有较大幅度的增加，其中外层型二次生长的增加幅度较大。改良蒜对低温和冷凉条件的反应较迟钝，内层型二次生长有所增加，不发生外层型二次生长的特性仍未改变。

秋播地区蒜头收获后，多在室温下贮藏，贮藏期间不会遇到容易诱发二次生长的低温和冷凉条件。但秋季播种后，从苗期到花芽、鳞芽分化发育期都会遇到低温和冷凉条件，所以蒜种即使不进行低温和冷凉处理，也有发生二次生长的可能，只是发生的严重程度较进行过低温和冷凉处理的要轻一些。

春播地区蒜头收获后要贮藏到翌年3-4月份播种，为了使蒜头不致受冻，贮藏场所的最低温度多控制在0℃左右，在长达7-8个月的贮藏期间以及早春露地播种后的一段时间，都具备诱发二次生长的低温和冷凉条件。

蒜种贮藏场所除温度对二次生长有影响外，空气相对湿度也有影响，而且温度与空气相对湿度之间有互作关系。据程智慧等报道，苍山大蒜于播种前30天在5℃和75%-100%空气相对湿度下贮藏的蒜种，秋播后，翌年外层型二次生长指数比在5℃和25%-50%空气相对湿度下贮藏的蒜种增加33倍；内层型二次生长指数增加19倍。而在15℃和25℃下贮藏的蒜种，不同空气相对湿度(25%-100%)间，无论是外层型二次生长还是内层型二次生长的发生程度均无显著差异。所以，为了减少二次生长的发生，在蒜种贮藏期间不但要避免低温，而且要避免75%以上的空气相对湿度。