回答棉花枯萎病菌的菌落因菌系、生理小种及培养基不同而有较大的差异，并无固定的形态，棉花枯萎病的病菌为尖孢镰刀菌，菌丝透明，具分隔，在侧生的孢子梗上生出分生孢子。该病菌的生理小种国外报道有6个，中国除第3号小种外新定7号、8号二个新小种，其中7号小种在中国分布广，致病强。