猪近亲繁殖会降低繁殖力，导致母猪产仔数减少，仔猪成活率降低，就算是成活下的仔猪体质也会很弱，生长缓慢，且会降低对外界不良环境的抵抗力；还会出现畸形怪胎或死胎，如仔猪出现没有肛门、耳朵、眼睛等，以及四肢发育不全等现象。