C2的驾照是不能开手动档的车的，因为C2驾照的准驾车型是自动档车。如果C3驾照开手动档被查，会被按照无证驾驶来进行处罚，根据《道路交通安全法》第十九条驾驶机动车，应当依法取得机动车驾驶证。申请机动车驾驶证，应当符合国务院公安部门规定的驾驶许可条件；经考试合格后，由机关交通管理部门发给相应类别的机动车驾驶证。