生化棉和过滤棉的作用是不同的。过滤棉一般是白色的，质地比较软，可以将脏东西过滤掉，主要用于物理过滤。而生化棉的作用是用来培养硝化细菌的，它的颜色多为黑色，同时有较大的空隙，属于生物过滤。值得一提的是，生化棉的代替有很多，比如细菌屋、陶瓷环等等。