北园面积更大一些。

　　北园是中国中、北亚热带的植物研究中心，拥有专类园(区)10个，设有观赏植物中心、药用植物中心、经济植物中心等以及江苏省药用植物研究开发中心、江苏省植物迁地保护重点实验室，还有华东地区较大的植物标本馆，拥有馆藏标本约70万份。还有桥世界，可供儿童玩耍。

　　南园

　　南园又名“江苏省中国科学院植物研究所植物博览园”，进去是前湖，能远眺前湖南边的明城墙。南园主要的展区都在前湖北边，按照景观侧重点分为11个区域: 热带植物宫、天草园、盲人植物园、盆景园、蔷薇园、药物园、松柏园、树木园、植物分类系统园和南京中山植物园自然教育区，共收集活植物约3000余种。