一、怀孕期间孕检扣工资怎么办?

劳动者可以到用人单位所在地的劳动监察部门进行投诉，也可以到用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。用人单位拖欠或者未足额支付劳动报酬的，劳动者可以依法向当地人民法院申请支付令，人民法院应当依法发出支付令。

法律上明确规定怀孕女职工在劳动时间内进行产前检查，所需时间计入劳动时间，既然计入劳动时间就必须给付劳动报酬，不能扣工资。如果孕期女职工按规定去产检，单位扣工资的行为违法。怀孕女职工在劳动时间内进行产前检查，所需时间计入劳动时间。用人单位不得因女职工怀孕、生育、哺乳而降低其工资、予以辞退、与其解除劳动或者聘用合同。女职工生育享受98天产假，其中产前可以休假15天。

二、公司扣工资的合法情形有什么?

1、用人单位不得克扣劳动者工资。有下列情况之一的，用人单位可以代扣劳动者工资：

(1)用人单位代扣代缴的个人所得税;

(2)用人单位代扣代缴的应由劳动者个人负担的各项社会保险费用;

(3)法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费;

(4)法律、法规规定可以从劳动者工资中扣除的其他费用。

2、因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%.若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。

怀孕期间被扣工资，员工可以去劳动行政部门投诉，用人单位为员工代缴个人所得税，给员工负担各项社会保险费用，可以代扣员工的工资。由于劳动者自身原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可以按照约定要求其赔偿经济损失，除这些情况外，用人单位不能随意扣工资。