一、公司在员工怀孕期间给降工资了合法吗?

是不合法的，首先要明确，在妇女劳动者怀孕期间降薪是不合法的行为。订立和变更劳动合同，应当遵循平等自愿、协商一致的原则，不得违反法律、行政法规的规定。劳动合同依法订立即具有法律约束力，当事人必须履行劳动合同规定的义务。

女职工在孕期、产期、哺乳期的;不得根据《劳动合同法》第40条和第41条中规定的解除合同和裁员，不得在女职工怀孕期、产期、哺乳期降低其基本工资，或者解除劳动合同。任何单位不得因结婚、怀孕、产假、哺乳等情形，降低女职工的工资，辞退女职工，单方解除劳动(聘用)合同或者服务协议。由此可见，女职工怀孕期间用人单位不得进行降薪。

女职工怀孕期间，用人单位不可以以怀孕为由调岗降薪，用人单位与女职工协商一致的，可以变更劳动合同调岗降薪。

二、单位拖欠怀孕员工的工资申请仲裁流程是什么?

法律并未具体规定拖欠的时间，通常情况下应该以劳动合同约定的日期为准发放工资。约定日期没有发放的就属于未及时发放工资。

1、去当地人力资源和社会保障机构(原劳动部门)内的劳动争议仲裁委，申请劳动仲裁。需提交的材料：仲裁申请书2份、申请人身份证复印件1份;相关证据复印件和证据清单2份;部分地区还需要提供用人单位的工商登记信息;

2、提交材料后，5个工作日仲裁委给予立案。劳动仲裁委不收费。然后给双方举证期;之后开庭审理，并且对双方进行调解，调解不成仲裁委会下达裁决书;劳动仲裁60天内结案。

公司在员工怀孕期间给降工资了，不符合法律规定，工资应该以劳动合同中约定的日期为准进行发放，超过这个日期属于未及时发放工资，员工可以去申请劳动仲裁，需要提交仲裁申请书，申请人的身份证明材料，相关的证据清单，用人单位的工商登记信息。