一、双方当事人在规定的时间内分别陈述意见和理由
陈述顺序先患方，后医疗机构。通常情况下，医患双方规定的陈述时间为20-30分钟;在对方陈述的过程中，另一方不允许发言和反驳对方的叙述。双方的陈述都是单方的叙述，不存在类似法庭辩论的情况。因此，在鉴定会上，即便是对方叙述的经过与事实出入很大，甚至对方做虚假陈述的，也不要有过激的行为。等待专家组组长许可后，再行发言。
二、专家鉴定组成人员根据需要可以提问
当事人应当如实回答。必要时，可以对患者进行现场医学检查;通常情况下，在双方当事人各自叙述完毕，补充说明后，专家组的成员会根据各自专业的情况，针对性的提出各自的问题。在鉴定会上问及医疗机构的问题，多数集中在诊断、治疗、处置方式、用药的选择和适应症、禁忌症上。而问及患者及其家属的问题，多数集中在既往病史、现病史、发病前情况、核实医疗机构救治的经过等方面。
三、双方当事人退场
在双方当事人完成上述程序后，会告知双方当事人退场，医学会会在约定的时间内，出具鉴定报告，并告知领取的时间。在这个时间，需要建议患者及其家属的是，在退场时，不要再向鉴定专家叙述情况;在退场的同时不要与医疗机构发生口角和冲突，既然大家想通过法制的途径解决问题的，就不要通过非理性的方式激化矛盾了。
四、专家鉴定组对双方当事人提供的书面材料、陈述及答辩等进行讨论
五、经合议，根据半数以上专家鉴定组成员的一致意见形成鉴定结论
专家鉴定组成员在鉴定结论上签名。专家鉴定组成员对鉴定结论的不同意见，应当予以注明。医学会参加医疗事故技术鉴定会的工作人员，会记录鉴定会过程和专家的意见。
专家的鉴定意见和签字记载在医疗事故鉴定的相关文件中，患者及其家属是看不到直接的文件的。这样可以依法保障专家们客观公正的进行事故鉴定。
