一、行为人犯徇私舞弊抵扣税款罪，致使国家利益遭受重大损失的，处五年以下有期徒刑或者拘役；若是致使国家利益遭受特别重大损失情形的，处五年以上有期徒刑。
二、法律依据：《刑法》第四百零五条
税务机关的工作人员违反法律、行政法规的规定，在办理发售发票、抵扣税款、出口退税工作中，徇私舞弊，致使国家利益遭受重大损失的，处五年以下有期徒刑或者拘役；致使国家利益遭受特别重大损失的，处五年以上有期徒刑。 其他国家机关工作人员违反国家规定，在提供出口货物报关单、出口收汇核销单等出口退税凭证的工作中，徇私舞弊，致使国家利益遭受重大损失的，依照前款的规定处罚。