经济案件证据不足的案件的处理方式在不同的阶段是不同的。
1、经济案在检察院证据不足如何处理人民检察院审查案件，可以要求公安机关提供法庭审判所必需的证据材料。人民检察院审查案件，对于需要补充侦查，可以退回公安机关补充侦查，也可自行侦查。对于补充侦查的案件，应当在一个月以内补充侦查完毕。补充侦查以二次为限。补充侦查完毕移送人民检察院后，人民检察院重新计算审查期限。对于补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合条件的，可以作出不的决定。
2、在阶段：严格按照《刑事诉讼法》的规定，证据不足应当作出证据不足，被指控罪名不能成立的无罪判决。但是在目前的国情下，证据不足的情况下，在量刑上尽量的从轻减轻已经是很不错了。判处无罪的很少。