1、单位处理劳动纠纷，可以采用以下方法：与劳动者协商；向调解组织申请调解；向劳动争议仲裁委员会申请仲裁；经过仲裁程序，向人民法院起诉。解决劳动争议，应当根据事实，遵循合法、公正、及时、着重调解的原则，依法保护当事人的合法权益。
2、法律依据：《劳动争议调解仲裁法》
第五条 发生劳动争议，当事人不愿协商、协商不成或者达成和解协议后不履行的，可以向调解组织申请调解；不愿调解、调解不成或者达成调解协议后不履行的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁；对仲裁裁决不服的，除本法另有规定的外，可以向人民法院提起诉讼。