1、分居两年不能自动离婚。离婚必须经过法定程序。必须由男女双方共同到一方当事人常住户口所在地的婚姻登记机关办理离婚登记。或者到法院起诉进行诉讼离婚。
2、分居时间应连续计算。因关于分居的举证比较困难，一般要双方共同认可。分居两年并不能自动离婚，它只是判断离婚的一个因素，离婚只有通过民政部门登记或者法院诉讼离婚才可以解除婚姻关系。