1、视具体情况而论。如果法院只是撤销了行政处罚行为，那么立案就是合法有效的，行政机关可以重新做出处罚，如果立案也涉及到违法不合理问题，法院一并撤销了行政处罚和立案，那么行政机关就需要重新立案。
2、根据《行政诉讼法》第七十条：行政行为有下列情形之一的，人民法院判决撤销或者部分撤销，并可以判决被告重新作出行政行为：
（一）主要证据不足的；
（二）适用法律、法规错误的；
（三）违反法定程序的；
（四）超越职权的；
（五）滥用职权的；
（六）明显不当的。