1、Kane美国大兵Kane，已婚，妻子叫Lena。Lena是大学生物教授，细胞研究方面的专家。Lena也是一名战士，两人在参军的时候认识并相爱。外星颗粒坠落在美国海岸边的一座灯塔内，形成Shimmer，并且范围不断扩大。政府成立组织Southern Reach（后简称SR）将附近的居民迁移走，并开始派遣一波又一波的队伍进入Shimmer研究。同时，Kane因为长期外出执行军事任务，妻子寂寞难耐，出轨大学的同事“黑人叔叔”。这件事情没有瞒得住Kane，但是嘴上Kane并没有什么，只是默默的忍受，装作什么都没有发生。但是不由自主地对Lena越来越疏远。俩人的关系出现裂痕。Lena也知道Kane其实知道了这件事情，心中非常悔恨。终于，SR在一波又一波的派遣队之后，找到了Kane，并安排他跟其他大兵一起进入Shimmer进行第11次探索。Kane答应了任务——因为对妻子的背叛深深地伤害，所以心灰意冷，并不在意Shimmer中的危险，打算“自我毁灭”。以前每次执行任务，Kane都会告诉Lena是去哪里，做什么任务，但这一次，Kane什么都没有说就离开了。Kane跟战友们进入了Shimmer，发生了一系列的事情，其中有个战友发现自己的肠子在肚子里蠕动，Kane用军刀切开了他的肚皮，发现真的肠子会动。这一幕也用摄像机记录了下来，并将内存卡放在一个袋子里，等待后来的人发现。这个战友后来自己爆炸了，血肉铺满了一整个墙壁。其他战友也都死掉了，没有走出Shimmer。Kane历经艰险，终于来到了中心——灯塔。用摄像机拍下了奇异的画面。更诡异的是，在这座灯塔里，Kane被克隆了另一个自己出来，他整个人奔溃了。加上身体发生着奇怪的变化，痛苦不堪忍受。在身体和精神的双重折磨之下，他用磷弹自杀了。自杀的一幕，还有克隆出来的Kane02都被摄像机拍下来了。Kane02合上摄像机，然后走出了Shimmer，跟随自己的感觉，回了家……

2、LenaKane离开去了SR的探索之后，Lena还是会不定期地跟黑叔约会，但是随着时间的推移，丈夫一直没有回来。可能是死了，也可能是因为发现她的出轨不再回来。Lena变得越来越焦躁，到处打听自己丈夫的消息。同时，因为不断产生的愧疚感，打算跟黑叔断绝来往，弥补过错。黑叔找她参加聚会，她也不拒绝了。说要“重新粉刷房间”，“重新粉刷房间”意味着她逃避自己的出轨事实，让房间焕然一新，也许就不会回忆起这个事。刷房间的过程中，丈夫回来了，一脸懵逼，说不清自己“到底经历了什么”。丈夫突然吐血抽搐，Lena赶紧叫了救护车。送医过程中，被军方强制劫持。

3、神秘组织SR醒来后来到了神秘组织SR，心理专家告诉了Lena关于Shimmer的事情，她丈夫的状况是因为进入Shimmer之后出来所以才这样，目前正在救治，不确定能不能救好。Lena也在SR认识到了几个计划第12次进入Shimmer的女性，分别有医学专家、物理专家、地貌专家，还有心理专家。Lena为了救治自己的丈夫，弥补自己对他的亏欠，决定一同前往。其实都是心理专家下的套，她作为心理专家，知道Lena想要什么，SR需要一个生物学家和战士，Lena是很好的人选。Lena对除心理专家之外的人，隐瞒了Kane是自己丈夫的事情。

4、第12次探索5个人一起进入了Shimmer，发生了各种奇怪的事情，所有的科学知识好像都在这里不受用，匪夷所思。信号发不出去、奇怪的植物和动物……。他们推测，这是因为Shimmer将所有东西折射了，所以才出现了这么多紊乱的现象和东西。在一个基地里，找到了之前Kane和战友带过的基地，还有那个内存卡，看到了被“切腹”的战友。晚上，Lena查看自己的细胞，发现折射的推断是对的。地貌专家被熊袭击，拖走，她的一部分意识——最后死亡的恐惧，渗入了这只熊的大脑，可以发出“救我”的声音，这变成了它诱捕人类的技能！第二天，Lena发现地貌专家的尸体大家都身体发生的不同程度的奇异变化。Lena的左手上开始出现“咬尾蛇”纹身。有一个晚上，医学专家绑架了全部人，发现了Kane原来是Lena的丈夫，认定Lena是“死骗子”，地貌专家也是Lena害死的，因为她没有看到熊，也没有看到尸体。就在这时，外边想起了地貌专家的呼喊声“救我！”医学专家心想“咦？没死！”，然后冲了出去打算救人，结果被熊袭击了，死心理专家想赶紧治好自己的癌症，提前出发去灯塔。物理专家一直对生命不留恋，几度想自杀。现在身体也出现异样，决定顺从自然地死去。最后，只剩下了Lena……

5、灯塔Lena独自走到了灯塔，看了之前Kane留下来的视频内容，发现原来Kane已经死了，而之前看到的是克隆出来的Kane02。在被外星颗粒撞击产生的黑洞中，发现了心理专家，因为身体变异，她的眼睛已经消失了。也有说法是这是克隆后的她，眼睛还没有生成。我更相信是前者，因为如果刚克隆出来，原来的那个人应该还在，而克隆出来的人应该还是“一脸懵逼”的状态。所以这个眼睛消失的应该还是心理专家本人。她说，有个东西进入了她的身体，很快他就要湮灭了。随着一声“变~身~”，哦，不是，“湮灭”！心理医生化作了一团东西，这团东西吸收了Lena的血液，运用她的DNA克隆出了另一个Lena，Lena02刚刚出生，智力低下，跟着Lena蹒跚学步，Lena接近要崩溃了，她要杀掉这个自己。于是拿起了Kane没用完的磷弹，给了Lena02，心想“这个玩具很好玩的！”Lena02接过磷弹，“卧槽！起火了！”出于本能，想回到娘胎离去，结果把娘胎也一起烧掉了，Lena逃出Shimmer，回了SR的基地。

6、第六章：尾声SR基地的人询问逃回来的Lena，队伍在Shimmer中发生了什么，队友哪去了Lena说了以上的故事。当问到“它”目的何在时，再一次强调了它“没有动机”！Lena见到了Kane02，他的身体已经无碍。但他已经不再是他。