1、成分不同。黑水晶的成分以二氧化硅为主，此外还含有铬，锰，铜等伴生矿，而黑曜石的成分是二氧化硅。

2、折射率不同。黑水晶的折射率在1.54～1.55之间，而黑曜石的折射率在1.48～1.51之间，因此黑水晶的光泽感更好。

3、产地不同。黑水晶在世界各地都有产出，例如马达加斯加，赞比亚，巴西，俄罗斯等，而黑曜石的主要产地为墨西哥，夏威夷，日本，印度等地。