1、留种采收株选结合果选的方法，即在田间根据品种特征选择标准株贴上标志，作为留种株。将其第层果早日采收上市，留2—4层果作为种果，种果红熟后采收时，进一步选择具有本品种特征的果实，采摘的种果摊放在阴凉处，后熟5—7天，剖开取出种子，晾干后贮藏。

2、专业制种：应当新鲜成熟辣椒剥取种子，然后再晒干保存。因为如果不先取出种子再晒的话，种子比较容易发霉，或颜色变暗，商品性降低。当然，如果是小量制种自己拿来种，直接把辣椒晒干保存，到种的时候再取种也是可以的。如果制种拿来卖，就须先取种再晒干，然后保存干种子，而不是干辣椒。