水稻穗颈瘟的特效药有：蜡芽菌、稻瘟灵、三环唑等药剂，它们都能够有效的进行防治病情的蔓延。其中75%的三环唑，最适合用于经常发生颈瘟的稻田里面，这样预防的效果是最好的。而在用药的时候，最好不要使用单一的药剂，以免病情产生抗病性，从而使药物没有什么作用。