芒果小穴壳蒂腐病是芒果贮运期间的病害，主要危害果实，产生经济损失，因此在树上时，可以使用甲基硫菌灵可湿性粉剂或多菌灵可湿性等药剂喷施防治，在采后可以使用咪鲜胺乳油或苯菌灵粉剂浸泡8分钟。