未满18岁申请入党的申请书不可以存档。未满18岁提出入党申请的党组织应肯定其入党要求，鼓励他们追求政治上的进步，并做好解释工作，请他们年满18岁后再向党组织正式递交入党申请书。对《中国共产党发展党员工作细则》公布之后、未满18岁发展入党的，报县级以上党委组织部门批准，不予承认，并视情况追究有关党组织及其负责人、直接责任人的责任。