显微镜上的光圈是在载物台背面上的孔，转动就可以调光圈的大小，调节光进入显微镜的多少，即是观察细胞时亮度的调节。大光圈是能让更多的广透过显微镜，在光线比较暗的时候用。小光圈是在比较亮的地方，或者看细胞中深色细胞器时用的，目的是减少光线。