1、原料不同：低芥酸菜籽油的主要原料为低芥酸油菜籽，是油菜籽的新品种。普通菜籽油的主要原料就是普通油菜籽。

2、口感不同：普通菜籽油的芥酸含量高，所以它的味道要更浓郁，口感更好。低芥酸菜籽油味道比较淡，偶尔会有涩涩的口感。

3、颜色不同：普通菜籽油的颜色比较深，大多是深黄色或褐色。低芥酸菜籽油颜色淡一些，一般为浅黄色。

4、芥酸含量不同：低芥酸菜籽油的芥酸含量比普通菜籽油低。