经过两年多第二次起诉离婚有效。

根据《中华人民共和国民事诉讼法》规定，判决不准离婚和调解和好的离婚案件，判决、调解维持收养关系的案件，没有新情况、新理由，原告在六个月内又起诉的，不予受理。因此，第二次两年多起诉离婚超过了法律规定不予受理的期限，所以是有效的。

《中华人民共和国民事诉讼法》第一百二十四条