1、定义不同，免税店指经海关总署批准，由经营单位在中华人民共和国国务院或其授权部门批准的地点。设立符合海关监管要求的销售场所和存放免税品的监管仓库，向规定的对象销售，供应免税店的商品。

2、一般商店是指个体经营户在符合国家政策法规的情况下，向工商部门申请的有一定经营范围的商店。

3、服务对象不同，免税店主要面向因公出国人员、远洋海员、华侨、外籍华侨、港澳台同胞、出国探亲的中国公民及在国内的外国专家等，一般商店面向所有的人。