2020黄马将继续沿用从科学城跑向知识城方案，并于12月3日完成了赛道丈量。赛事起点和半程马拉松终点为科学城绿轴广场，迷你马拉松终点为荔红二路，马拉松终点为知识城北门。

　　半程马拉松赛道环绕科学城奔跑，道路平坦，视野开阔，绿树成荫，非常有利于运动员发挥。全程马拉松从科学城一路向北，经过“三桥三隧”，最终抵达中新广州知识城北门。知识城北门两侧的5株智慧树，在造型上融合了新加坡著名景点“超级树”和广州“小蛮腰”的形态，寓意中国和新加坡在知识城的合作成果多、前景广阔。

　　▷全程马拉松（42.195km）

　　绿轴广场（起点）—科学大道—开泰大道—开源大道—永和隧道—永和大道—永安大道—永龙大道—永龙大道隧道—永龙大道—兴龙大道—振兴公路—九龙大道—凤凰五路（折返）—知识城北门（终点）

　　▷半程马拉松（21.0975km）

　　绿轴广场（起点）—科学大道—开泰大道—新桂路—光谱东路—光谱中路—光谱西路—光宝路—科学大道—科珠路—科翔路—神舟路—斑鱼塘路—香山路—金峰园路—科翔路—开泰大道—科学大道—绿轴广场（终点）

　　▷迷你马拉松（约6km）

　　绿轴广场（起点）—科学大道—开泰大道—荔红二路（终点）