数据库系统与文件系统的主要区别如下：

1、数据库系统主要管理数据库的存储、事务以及对数据库的操作。文件系统是操作系统管理文件和存储空间的子系统，主要是分配文件所占的簇、盘块或者建立FAT、管理空间空间等。

2、数据库系统是由数据库及其管理软件组成的系统。主要包括操作系统、各种宿主语言、实用程序以及数据库管理系统。

3、文件系统用文件将数据长期保存在外存上，数据库系统用数据库统一存储数据。

4、文件系统中的程序和数据有一定的联系，数据库系统中的程序和数据分离。

5、文件系统用操作系统中的存取方法对数据进行管理，数据库系统用DBMS统一管理和控制数据。