1、性质上不同。
（1）代位权是法定的债权的权能，是债的保全方法之一。债权人以诉讼的方式行使代位权就产生了代位诉讼，代位诉讼与是直接诉讼的对称。
（2）代位申请执行是一种强制执行手段，它并非法定债权的权能，也不是债的保全方法。不仅直接诉讼获得胜诉判决后，债权人可以申请执行债务人对
（3）第三债务人已到期的债权。即便在代位诉讼获得胜诉判决后，如果第三债务人(被执行人)不能清偿债务时，债务代位权人还可以申请执行第三债务人对第四债务人的到期债权。
2、代位权的客体范围广于代位申请执行的客体范围。
一般而言，代位权的客体为债务人对第三人的权利，但非财产权利、主要在于保护权利人无形利益的财产权、禁止扣押的权利及不得转让的权利除外。
3、适用的条件不同。
代位权的适用条件为：
(1)债务人怠于行使其到期债权;
(2)对债权人造成了损害。
而代位申请执行仅适用于：
(1)案件已审结，当事人已经取得发生了法律效力的、有具体给付内容的判决书、调解书、公证机关出具的有执行效力的债权文书、仲裁裁决等执行根据，且当事人已向提出执行申请，即进入了强制执行程序;
(2)被执行人不能清偿债务，无论其是否怠于行使其对第三债务人的债权;
(3)被执行人(债务人)对第三债务人享有已经到期的债权;
(4)第三债务人对债务没有异议但又在指定的期限内不履行。
4、效果不同。
代位权行使后即代位诉讼获得胜诉判决后，第三债务人应该向债务人清偿债务，并且该第三人所交付的财产应作为债务人的总财产，向全体债权人清偿。代位的债权人并不能因此而获得优先受偿权。
